एसएमयू की स्थापना तब हुई जब उच्च शिक्षा अधिनियम 1997 की धारा 20 (1997 का अधिनियम 101) की धारा 20 के संदर्भ में उच्च शिक्षा और प्रशिक्षण मंत्री डॉ। ब्लेड नजीमांडे ने एसए गवर्नमेंट गजट में Sefako Makgatho Health Sciences University 37658 16 मई 2014 को।
इस घोषणा के बाद 2011 में मंत्री नजीमंडे द्वारा की गई घोषणा के बाद उन्होंने लिम्पोपो विश्वविद्यालय से मेडुन्सा कैम्पस को अलग करने के अपने इरादे की घोषणा की। मंत्री का इरादा टास्क टीम के निष्कर्षों और सिफारिशों पर आधारित था और इसकी स्थापना और नेतृत्व प्रोफ़ेसर मालेगापुरु मकगोबा ने किया था, जो केवा-ज़ुलु नेटाल विश्वविद्यालय (यूकेज़ेडएन) के पूर्व कुलपति और डॉ। मैक्स प्राइस, केपटाउन विश्वविद्यालय के कुलपति थे। (UCT)।